منابع دانشجویی از همکاری دانشگاه‌ها با نهادهای بالادستی و امنیتی در سرکوب تشکل‌های مستقل دانشجویی خبر داده‌اند.
انجمن علمی انسان‌شناسی دانشگاه تهران در گزارشی که به‌تازگی منتشر کرده، از رد صلاحیت دست کم ۳۰ دانشجو در انتخابات اخیر انجمن‌های علمی خبر داده است.
به گزارش این انجمن و به نقل از دبیر کمیته انضباطی این اقدام «بر اساس بخشنامه‌های جدیدی که توسط شورای امنیت کشور به دانشگاه ابلاغ شده، صورت گرفته است و به دانشگاه و حراست این امکان را می‌دهد که دانشجویان را به‌دلایلی چون عدم رعایت حجاب اجباری، شرکت در تجمعات و اعتصابات از ورود به تشکل‌های علمی و صنفی محروم کنند.»
دبیر کمیته انضباطی هم‌چنین به دانشجویان گفته است که «مصوبات شورای امنیت کشور، اختیارات فراقانونی جدیدی مانند قطع حقوق اساتید تا زمان رسیدگی به پرونده آنها، بدون نیاز به حکم قانونی، به مسئولان دانشگاه و حراست داده است.»
در جریان اعتراضات سراسری ۱۴۰۱ دانشگاه‌ها از مهم‌ترین کانون‌های تجمع‌های اعتراضی به‌شمار می‌رفت. بر اساس گزارش‌های متعدد، فشار و سرکوب دانشجویان در ماه‌های گذشته افزایش یافته است و بسیاری از دانشجویان از امنیتی شدن فضای دانشگاه‌ها خبر داده‌اند.