رهبر جمهوری اسلامی طی حکمی احمد خاتمی را به عضویت شورای نگهبان درآورد و او را جایگزین محمد یزدی کرد. علی خامنه‌ای در حکم خود علت این تغییر را کهولت سن و عارضه بیماری محمد یزدی اعلام کرده است.
علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی در حکمی که در رسانه‌های ایران منتشر شده است، عضویت سید احمد خاتمی در شورای نگهبان را اعلام کرد.
در حکم علی خامنه‌ای آمده است که شیخ محمد یزدی «به خاطر عوارض جسمی و کهولت» از عضویت در شورای نگهبان استعفا داده است.
مطابق قانون اساسی جمهوری اسلامی، شورای نگهبان یک نهاد نظارتی است. تمامی قوانین مصوب مجلس شورای اسلامی باید به تأیید این شورا برسد. از سوی دیگر تأیید صلاحیت نامزدهای تمامی انتخابات سراسری کشور به جز انتخابات شوراهای شهر و روستا نیز در حیطهٔ وظایف این شورا جای دارد.
از دوازده عضو این شورا شش عضو آن فقهایی هستند که با حکم رهبر جمهوری اسلامی علی خامنه‌ای عزل و نصب می‌شوند و شش عضو دیگر حقوقدانانی هستند که رئیس قوه قضاییه انتخاب کرده و برای اخذ رای اعتماد به مجلس شورای اسلامی معرفی می‌کند.
دبیر شورای نگهبان بالاترین مقام رسمی این شورا است و در حال حاضر احمد جنتی ۹۴ ساله دبیر کنونی آن است.
احمد جنتی از دوره اول شورای نگهبان در سال ۱۳۵۹ به‌عنوان عضو فقهای این نهاد منصوب شد و از سال ۱۳۷۱ دبیری این شورا را بر عهده داشته‌است.