شهین خاکپور، ۲ خرداد ماه سال ۹۸ توسط ماموران اداره اطلاعات سپاه کرمان بازداشت شد. خاکپور روز چهارشنبه ۸ مرداد ۱۳۹۹، توسط شعبه اول دادگاه_انقلاب کرمان به اتهاماتی چون «اقدام علیه امنیت ملی از طریق تشکیل گروه‌های مخالف نظام»، «فعالیت تبلیغی علیه نظام به نفع گروه‌های مخالف نظام» و همچنین توهین به خامنه‌ای جمعاً به ۱۸ سال زندان محکوم شد.
جلسه دادگاه شهین خاکپور بدون دسترسی به وکیل و با علم قاضی به این که او به نوعی بیماری اعصاب و روان مبتلا است برگزار شد. این فعال مدنی مشروطه خواه, ساکن کرمان, در تاریخ هشتم مهر ۱۳۹۹ و با یورش نیروهای امنیتی به منزلی که در آن میهمان بود، بازداشت و جهت اجرای حکم، به زندان کرمان منتقل شد.
خاکپور که هم اکنون در زندان کرمان در حال سپری کردن دوران حبس ۱۸ ساله خود است سابقه ابتلا به نوعی بیماری اعصاب و روان داشته که به تایید کمیسیون پزشکی نیز رسیده بود. اما در حال حاضر و علیرغم بیماری شدید جزای انتقاد از خامنه‌ای را با جسم و روان خود می‌پردازد.